1997年，Hanish和Eke等進行的動物實驗研究表明，在種植體周炎患者的種植體周可檢測到與牙周炎有關的牙周致病菌，如牙齦嚇咻單胞菌、伴放線放線桿菌。通過暗視野顯微鏡觀察發現，牙齦嚇嘛單胞菌、中間普羅威登斯菌由絲線結紮前的1%上升到10%,鏈球菌由於40%-60%減少到0.2%-0.5%,球菌減少，革蘭陰性厭氧桿菌的比例增加，能動菌的數量增加。國內學者的觀察結果也顯示。
種植體周炎及牙周炎齦下菌群以革蘭陰性厭氧菌為主，占89.7%,並隨探診深度的增加，可培養菌的總量及革蘭陰性厭氧桿菌所占比例增高。以上的一系列研究提示，種植體周炎的發生和發展與牙周炎的形成機制相似。
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