1.成功種植體周的牙菌斑
成功種植體周的微生物與健康牙周的齦下微生物相似，種植體周健康部位的菌斑主要為革蘭陽性需氧或兼性厭氧球菌及非能動菌。1988年Mombelli等對18名無殆患者植人種植體2年後全部成功的骨整合種植體周菌斑的組成進行觀察，發現菌斑中50%的細菌是兼性厭氧球菌，17%是兼性厭氧桿菌，且同一患者不同部位的菌斑的細菌組成相似。這證實了種植體周齦下菌群來自口腔正常菌群。
2.種植體黏膜炎的牙菌斑
齦炎與種植體周黏膜炎，牙周炎與種植體周炎的菌斑組成相似。1992年，Berglundh等建立了狗的天然牙牙齦炎和種植體周黏膜炎（BrSnemake系統，ITI系統，AstraTeah系統）的實驗模型，在3周和3個月後，對其周圍菌斑進行分析、比較，發現無論是菌斑的量，還是菌斑組成都有其相似性，隨著菌斑聚集的時間增長，齦下菌斑中能動菌的數量明顯增加；活體組織檢査證實，與結締組織中炎症細胞的浸潤類似，並有向根尖方向擴展的傾向。1994年，Pontoriem等對20名成人自願者的天然牙和種植牙的觀察發現，在停止口腔衛生3個月後，天然牙周和種植牙周均出現軟組織水腫，且探診深度增加了
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